Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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