Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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