Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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