Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PRKD1Q15139 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PRKD1Q15139 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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PRKD1Q15139 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PRKD1Q15139 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PRKD1Q15139 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PRKD1Q15139 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PRKD1Q15139 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PRKD1Q15139 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PRKD1Q15139 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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