Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms