Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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BRD3Q15059 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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BRD3Q15059 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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BRD3Q15059 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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