Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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