Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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SCARF1Q14162 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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