Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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