Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms