Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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PKP1Q13835 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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PKP1Q13835 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PKP1Q13835 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PKP1Q13835 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PKP1Q13835 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PKP1Q13835 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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