Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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