Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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