Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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