Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
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