Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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