Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FOXC1Q12948 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FOXC1Q12948 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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