Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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TRAF2Q12933 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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TRAF2Q12933 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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