Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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