Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms