Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms