Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms