Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms