Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms