Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms