Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN11Q06124 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms