Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms