Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPCQ01831 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPCQ01831 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPCQ01831 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPCQ01831 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPCQ01831 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPCQ01831 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPCQ01831 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPCQ01831 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms