Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB1P82279 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB1P82279 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB1P82279 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB1P82279 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB1P82279 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB1P82279 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB1P82279 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB1P82279 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB1P82279 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB1P82279 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB1P82279 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms