Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms