Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF10P55107 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF10P55107 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF10P55107 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF10P55107 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms