Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms