Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV1P50549 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms