Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRT6CP48668 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRT6CP48668 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms