Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCCP43146 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCCP43146 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCCP43146 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DCCP43146 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCCP43146 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCCP43146 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCCP43146 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DCCP43146 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCCP43146 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCCP43146 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCCP43146 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCCP43146 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCCP43146 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCCP43146 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms