Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KDM5CP41229 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms