Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GGCXP38435 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GGCXP38435 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GGCXP38435 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GGCXP38435 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGCXP38435 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGCXP38435 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGCXP38435 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms