Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms