Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER1P34995 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms