Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms