Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms