Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms