Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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