Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms