Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms