Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYF6P23409 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYF6P23409 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYF6P23409 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms