Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA6P23280 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA6P23280 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA6P23280 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA6P23280 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA6P23280 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA6P23280 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA6P23280 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA6P23280 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA6P23280 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA6P23280 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA6P23280 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms