Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms