Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPI1P17947 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPI1P17947 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPI1P17947 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPI1P17947 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms