Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB3P16520 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB3P16520 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB3P16520 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GNB3P16520 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms